В соответствии с приказом Министерства труда и социальной защиты РФ Сергей Чирков назначен на должность заместителя Председателя Правления Пенсионного фонда России. На новую должность он переведен с должности начальника Департамента организации назначения и выплаты пенсий.
Профессиональную деятельность в Пенсионном фонде Сергей Чирков начал в 2001 году в должности главного специалиста отдела по оценке пенсионных прав. В феврале 2007 года возглавил Департамент по вопросам пенсионного обеспечения лиц, проживающих за границей. С июля 2012 года приступил к обязанностям начальника Департамента организации назначения и выплаты пенсий.
Награжден почетной грамотой Министерства здравоохранения и социального развития РФ, почетной грамотой Пенсионного фонда РФ. Имеет благодарность Правительства РФ, а также благодарность Комитета Государственной думы по труду, социальной политике и делам ветеранов. Награжден медалью ордена «За заслуги перед отечеством» второй степени.